Jurusan Teologi STAKPN Burere Sentani sebagai sebuah lembaga pendidikan tinggi teologi yang bercorak oikumenis, sesungguhnya menempati posisi yang sangat strategis dalam mempersiapkan, menempa dan menghasilkan tenaga-tenaga pelayan yang handal dengan spiritualitas yang tinggi serta kemampuan berteologi secara operasional yang relevan. Keberadaan Progra Studi Teologi sebagai salah satu Program Studi yang ada di STAKPN Sentani yang didirakna pada tahun 2003 melalui surat keputus Ketua STAKPN-Sentani Nomor : STK.03/PP.009/470/2003 tentang pembukaan jurusan Teologi.
Dengan kata lain pengembangan program jurusan teologi dilakukan secara sistemik, yakni dimulai dari visi dan misi. \012Beranjak dari paradigma diatas serta berdasarkan penyusunan visi dan misi STAKPN Burere Sentani, maka proses awal perumusan visi dan misi Jurusan/Prodi Teologi melalui pertemuan yang dilakukan dengan evaluasi diri yang komprehensif dengan melibatkan Dosen Jurusan Teologi STAKPN kemudian hasil rumusan visi dan misi diajukan ke Pimpinan Jurusan, Pembahasan visi dan misi Prodi Teologi dilanjutkan dalam sebuah pertemuan antar Jurusan Pendidikan Agama Kristen (PAK), Teologi dan Musik Gereja yang pada akhirnya terciptalah visi dan misi Jurusan Teologi.
Hal yang utama dalam sebuah lembaga pendidikan formal, yaitu keberadaan keabsahan secara hukum. Jurusan Teologi pada tahun ini, ada dalam suatu proses reakreditasi, itu berarti bahwa Jurusan Teologi merupakan lembaga pendidikan formal yang berdiri dan terdaftar di bawah aturan yang berlaku di Indonesia.
